Unatoč svim prednostima, pouzdanost primjene, visoke kontracepcijske učinak, kontraceptivi mogu uzrokovati ozbiljne nuspojave i uzrokovati opasne bolesti.
Glavobolja pilule mogu biti uzrokovani migrenom - to je najčešća nuspojava. Popis kontraindikacija za uporabu kontracepcijskih pilula uključuju: hipertenziju, bolesti srca, moždani udar, trombozu, vaskularnih komplikacija u šećernoj bolesti, tromboembolija, pušenje više od 15 cigareta dnevno u dobi od 35 godina.
Ako nakon primitka kontraceptiva glavobolja pojavila iznenada vrlo intenzivno, u pratnji otežano disanje, bol u prsima, odmah treba pozvati hitnu pomoć. Prethodnici srčanog udara, moždanog udara, teške glavobolje praćene mučninom, otežano disanje, bol širi na lijevom ramenu ili preko prsnog koša.
Kad se sustavno javljaju bolovi trebali posjetiti liječnika. Nakon liječničkog pregleda liječnik će propisati i druge hormonske kontraceptive ili savjetovati alternativne metode kontracepcije.
Neovisno ne samo da se ne bi trebao početi uzimati oralnu kontracepciju, ali i oštro ih otkazati. To može dovesti do teške hormonalne kvara i ozbiljnih zdravstvenih problema. Dakle, recepcija, i ukidanje potrebe uskladiti sa svojim liječnikom.